Стојковић је у изјави агенцији Танјуг најавио да ће у окружним судовима у Београду, Новом Саду и Нишу бити оформљена посебна одељења за те предмете, као и истражна одељења, док ће одељење у Врховном суду Србије бити другостепени суд. Он је додао да ће и у Тужилаштву и равобранилаштву бити основано посебно одељење за војне тужиоце и правобраниоце.
Према његовим речима, судије које су радиле у војном правосуђу моћи ће да наставе рад у цивилним судовима уколико испуњавају услове из Закона о судовима, односно ако имају завршен правни факултет и положен правосудни испит, док ће војне судије који не испуњавају ове услове остати у Војсци.
Стојковић је објаснио да ће поред војних судија у посебним већима радити и судије окружних судова, који ће у том случају морати на специјализацију јер су у питању војна кривична дела која су специфична.
Министар је рекао да не очекује да ће бити пребачен велики број кривичних предмета јер су око 70 одсто предмета управни спорови, због чега ће морати да се бирају нове судије за ту материју.
Он је навео да би за најлакша кривична дела требало извршити аболицију, како би се на тај начин смањио број кривичних предмета јер је највећи број управо везан за "ситан" криминал и најавио да ће за притворена или осуђена лица за војна кривична дела у постојећим затворима бити формиране посебне затворске јединице.